Kimariyb's Blog

本文将使用计算化学程序 Gaussian、orca、xtb 以及 molclus 对阿司匹林做构象搜索。

Chem3D 是 ChemOffice 软件包中的子软件之一，其可以非常方便的与另外一个子软件 ChemDraw 联动使用。以致于很多人使用 ChemDraw 把画好的结构式转化为 mol 文件后，再使用 Chem3D 优化，并将得到的结果当做真理，这是十分可笑的一件事。

KimariPlot 是一个用来绘制化学能量图的小程序，目前来说功能不多，但是绘图十分简单，懒人专用。目前开源于 Github (https://github.com/kimariyb/kimariPlot)

IRI 是 Sob 命名的一种研究相互作用的实空间函数，本文主要介绍其等值面图的绘制的方法。本文参考了 Sob 老师《使用 IRI 方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用》(http://sobereva.com/598)一文。

LOL-pi 是被笔者经常用来研究电子离域路径的实空间函数，本文主要介绍其绘制的方法。本文参考了 Sob 老师《在 Multiwfn 中单独考察 pi 电子结构特征》(http://sobereva.com/432)一文。

本文主要介绍如何在 Fedora Linux 安装 Gaussian 16 以及配套的 GaussView 6。参考了 Sob 老师的文章《Gaussian 的安装方法及运行时的相关问题》(http://sobereva.com/439)。

本文主要参考 Sobereva 博客《使用 AICD 2.0 绘制磁感应电流图》(http://sobereva.com/294)、《使用AICD 程序研究电子离域性和磁感应电流密度》(http://sobereva.com/147)。

本文主要参考 Sobereva 博客《考察分子磁感生电流的程序 GIMIC 2.0 的使用》(http://sobereva.com/491)的操作，但是略微有所不同。

本文主要参考 Sobereva 博客《通过 Multiwfn 绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性》(http://sobereva.com/216)进行绘制的，记录不同的使用习惯。

本文旨在为没有科班背景的科研工作者提供一份手把手教程，教授如何安装并使用功能强大的中科院学术Chatgpt。对于那些没有编程或技术背景的用户来说，安装和使用科研工具可能会稍显困难。因此，我将尽力详细说明每一个步骤，确保每个人都能轻松地安装和使用该工具，从而提高科研效率。